Fallout.3 es un juego en el cual el tema principal es la guerra, la historia trata de una bóveda llamada Almacén 101, en la cual los residentes de esta han sido libre de la guerra que se vivía afuera, este lugar después de la guerra cambio drasticamente ahora viven criaturas como Insectos gigantes, Raiders, esclavistas, incluso Super Mutantes.
Un día un soldado se despierta descubriendo que su padre una habitante de la bóveda ha dejado este recinto tan seguro, así que el sale en su búsqueda arriesgandose afuera con todos estos peligros que se presentan con al única finalidad de hallarlo.